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본 학과 제어공학을 기계공학에 접목시킨 첨단 학문분야를 연구, 교육함을 목적으로 공과대학에서는 제일 먼저 개설되었다. 1973년 학과개설이래 석사 120명, 박사 34명이 배출(2004년 3월현재)되었으며 배출된 유능한 인재들이 학계(대학), 선박검사협회, 연구소, 선박 ALCC 조선 업계, 기계 산업분야 등에서 국가발전을 위해 크게 기여하고 있다.
「21세기 지식기반사회 대비 고등인력양성산업(Brain Korea21:BK21)」중 지역대학 육성 사업의 주관대학으로 선정되어 재학생을 위한 장학제도 (RA.TA)가 있어 재학생의 대부분이 장학혜택을 받고 있다. 본 학과에는 기관공장 및 각종 실험 실습실을 구비하고 있으며, 구비된 실험장비 등을 이용하여 철저한 기본적인 실험을 행하게 하고 나아가 심도 있는 연구를 하도록 유도한다.
현대사회는 정보지식화 및 디지털화 되어가고 있으며, 특히 6T가 이끄는 첨단산업시대이다. 이에 발맞추어 제어 기계공학은 기계공학분야와 전자 및 제어공학이 융합된 기계제어시스템의 설계, 제작, 운용 등을 중점적으로 다루는 미래의 첨단 학문 분야이다. 따라서 본 학과는 각종 기계시스템의 정밀화, 자동화 및 지능화 발전을 도모하며 현대사회에 크게 기여할 창의력과 지도력을 갖춘 고급 연구인재를 양성함을 목적으로 한다.
본학과는 고급연구인재의 양성을 목적으로 ‘73년에 대학원 기관학과 석사과정, ’82년에 대학원 기관학과 박사과정으로 개설되었으며 제어공학을 기계공학과 접목시킴으로서 첨단 학문을 다루는 연구와 교육을 위해 ‘97년에 대학원 제어기계공학과로 명칭 변경되었다. 본학과의 연구 및 교육분야는 크게 나누어 열공학분야, 유체공학분야, 재료 및 진동공학분야, 전기 및 제어공학 분야등의 4분야로 구성되어있으며 창의적 연구를 위해 각분야의 연구실을 활발하게 운영하여, 학문적 성장을 도모하고 있다.